19 июня 1992 года создан Попечительский совет ТИИ, который возглавил Юрий Николаевич Вершинин, к. т. н., академик АТН, начальник НПО «Тюменнефтегаз», почетный профессор ТюмГНГУ. Главная функция попечительского совета — способствовать развитию вуза, привлекать денежные средства, определять пути их расходования. Во многом созданию совета способствовал глава администрации Тюменской области, выпускник вуза Ю. К. Шафраник. В числе попечителей оказались ведущие предприятия нефтегазовой отрасли, и это помогло институту выстоять в трудные девяностые годы прошлого века.

В разное время попечительский совет  направлял на развитие университета от 26 до 48 млн. рублей. Эти средства не так  велики по сравнению с тем, сколько зарабатывает сам вуз — 1,8 млрд. рублей в год, однако вклад от них ощутим.

В 2007 году председатель Союза нефтегазопромышленников России Юрий Константинович Шафраник возглавил попечительский совет ТюмГНГУ, в который вошли 53 предприятия не только нефтегазовой сферы, но и других отраслей, гиганты ТЭК и организации с численностью работников не более тысячи человек.

В 2014 году в вузе создан фонд целевого капитала, попечительский совет которого возглавляет губернатор Тюменской области Владимир Якушев. В эндаумент-фонд входят 15 руководителей крупнейших предприятий нефтегазовой отрасли и выпускники вуза, а также коллектив вуза.

Согласно принятому уставу, средства фонда используются на укрепление материально-технической базы университета, модернизацию его образовательных программ, финансирование инвестиционных проектов, научно-исследовательской, внеучебной деятельности студентов и преподавателей университета, совершенствование системы его управления.