Проводить в последний путь этого великого человека пришли его родные, друзья, коллеги, руководители предприятий и представители органов власти, ученики, все те, кто знал и кому он был дорог, с кем ему приходилось сотрудничать в самых разных условиях при решении научных, поисковых, изыскательских, административных и общественных проблем. Его глубоко уважали и ценили в научных кругах, руководители самых высоких рангов, все восхищались его замечательными качествами человека-самородка, далеко обогнавшего своё время. Для Тюменского индустриального университета, Тюменской геологии утрата тяжела и невосполнима, но остаются научные труды Ивана Ивановича, тысячи его учеников, дети и внуки, которым предстоит воплотить его грандиозные идеи.

Соболезнования родным и близким выразил губернатор Тюменской области Александр Моор: «Иван Иванович был легендарным человеком, преданным науке и Тюменской земле. Человек – эпоха. Человек – глыба. С его именем неразрывно связано становление и развитие Тюменской области, как нефтегазового опорного края нашей страны. Своими научными исследованиями Иван Иванович предопределил роль нашего региона в развитии России, он внёс неоценимый вклад в развитие отечественной геологии и вписал в историю нашей страны много яркий открытий, которыми мы гордимся. Он воспитал многочисленную плеяду своих учеников, настоящих профессионалов, которые также, как и он, преданы своему делу. Его сердце всегда горело работой, а его дерзкие замыслы и глубинные предвидения, которые не всегда разделяли окружающие, он очень упорно и смело претворял в жизнь. Всю свою жизнь Иван Иванович очень много работал, он был верен своим жизненным принципам, и каждый день хотел приносить пользу людям и стране. Он ушел, но его идеи, его открытия и вклад в мировую науку навсегда останутся ценностью для будущих поколений. Светлая память об этом удивительном и неординарном человеке останется в наших сердцах».

От имени депутатов Тюменской областной Думы к присутствующим обратился Председатель Думы Сергей Корепанов: «Ушёл из жизни матёрый учёный и замечательный человек Иван Иванович Нестеров. Человек, который всю свою жизнь посвятил геологии, нефтегазовому комплексу страны. Коллеги называли его Геологом от Бога с вечно молодой душой первооткрывателя. Он участвовал в открытии многих крупных месторождений нефти и газа, среди которых: Уренгойское, Самотлорское, Усть-Балыкское и другие. Он — лауреат Ленинской премии, кавалер многих орденов и почётных званий. Ивана Ивановича не стало, но остались его ученики, остались его воспитанники, они, безусловно, продолжат его дело. Светлая память о нём навсегда останется в сердцах родных и друзей, коллег и учеников».

«Тот вклад, который Иван Иванович сделал в развитие нашей Тюменской земли неоценим! – отметил заместитель губернатора ЯНАО Александр Мажаров. – Он внёс огромный вклад в благополучие людей, проживающих в Ямало-Ненецком автономном округе, благополучие людей Тюменской области, энергетическую безопасность России. Мы благодарны ему. Конечно, он многое ещё не успел сделать, многое осталось в его научных записках, трудах. Наш долг — как можно быстрее воплотить его идеи. Он был награждён орденом Рубиновой звезды Ямало-Ненецкого автономного округа за номером один. Спасибо Вам, Иван Иванович за всё, что Вы сделали, низкий Вам поклон».

«Месторождения, в открытии которых он участвовал, гремели не только на всю Россию, они гремели на весь мир, и ещё долгие годы мы будем пользоваться теми плодами, которые в своё время были открыты Иваном Ивановичем. Он всегда был в строю, делился своими знаниями со студентами, рассказывал всё, что знал, молодым тюменцам, юным геологам. Имя Ивана Ивановича навсегда вписано в историю нашего региона. Он навсегда остаётся Почетным гражданином города Тюмени, мы всегда его будем помнить», — подчеркнул глава города Тюмени Руслан Кухарук.

Соболезнования всем тюменцам, геологам и геофизикам России от лица министра геологии СССР Евгения Александровича Козловского, Сибирского отделения Российской академии наук, Института нефтегазовой геологии и геофизики им. А. А. Трофимука СО РАН и от себя лично выразил руководитель научного центра Сибирского отделения РАН, академик Алексей Конторович.

«Сегодня у нас тяжёлый день. Российская земля потеряла одного из самых талантливых своих людей. Иван Иванович войдёт в историю страны в плеяде выдающихся геологов, создавших теоретические основы и богатства её нефтегазового комплекса. Память об Иване Ивановиче, как одном из ведущих создателей нефтегазового комплекса России и человека, внёсшего уникальный вклад в теоретическую геологию нефти и газа, навсегда останется и будет прописана в учебниках. Я хотел бы отметить ещё одну черту Ивана Ивановича. Это был удивительный семьянин, он очень заботился о своей семье, о детях, занимался их воспитанием, любил их и активно участвовал в том, чтобы они стали полноценными гражданами нашей страны. У Ивана Ивановича было много друзей. Я горжусь тем, что нас связывали 60 лет совместной работы и большой междусемейной и человеческой дружбы. Такие люди остаются в памяти и современников, и последующих поколений  навсегда».

Предложение о необходимости создания в Тюмени Аллеи первооткрывателей высказал генеральный директор ОАО «Сибирский научно-аналитический центр» Анатолий Брехунцов. «Необходимо создать в Тюмени Аллею первооткрывателей ТЭК, на которой запечатлеть имена таких гигантов, как Иван Иванович. Чтобы вклад этих людей в развитие и процветание нашей страны был очевиден для потомков. Надеюсь, что наше предложение будет услышано и такая аллея будет создана. Хотелось бы, чтобы дело Ивана Ивановича, его идеи и предложения, созданные им научные труды, имели бы достойное продолжение», — подчеркнул Анатолий Михайлович.

«Мы потеряли редкого человека, учёного, глыбу, явление и целый интеллектуальный и человеческий пласт жизни, — сказала на траурной церемонии прощания и.о. ректора ТИУ Вероника Ефремова. — Для нас это было неожиданно, мы думали, он вечен. Тюменский индустриальный университет скорбит. Сейчас нам нужно просто справиться с этой утратой, а задача вуза и учеников Ивана Ивановича – не уронить заданную им планку, чтобы тюменская геология, по-прежнему, была ценна кадрами, чтобы возникали такие глыбы, как Нестеров. Иван Иванович был настолько деятельным, что смириться с тем, что его теперь с нами нет, пока невозможно. У него всегда было много идей. Мы всерьёз, а то и полушутя  говорили о 95 его научных разработках совершенно новых технологий, и это так. Безусловно, это была работа и окружающих его учеников. Я очень надеюсь, что в силу их характеров, после тяжёлого часа утраты они вновь вернутся и воплотят научные идеи своего Учителя в жизнь».

Глава опорного университета сказала, что память об этом великом человеке будет увековечена. «Это имя золотыми буквами вписано в историю университета и навсегда останется в сердцах студентов и преподавателей», — добавила она.

Искренние соболезнования родным, близким и коллегам в связи с кончиной выдающегося советского и российского учёного-геолога, Иван Ивановича Нестерова выразили руководство и коллектив АО «СНИИГГиМС»: «Иван Иванович внёс неоценимый вклад в развитие отечественной геологии, нефтегазового комплекса. С его именем связано становление и развитие Тюменской области как нефтегазового опорного края страны. Он вписал в историю немало ярких открытий, которыми гордится Россия. Воспитал многочисленную плеяду учеников, настоящих профессионалов».

Письмо-соболезнование в адрес ТИУ, родных и близких Ивана Ивановича пришло от и.о. главы Тавдинского городского округа Константина Баранова, председателя Думы  Дмитрия Нохрина и коллектива администрации Тавдинского городского округа.